查理五世知道，早在他出生之前，西班牙王室就一直努力厘清印第安政策。当哥伦布呈报西班牙新获得众多且在此之前无人知晓的臣民时，他的祖父母费迪南德国王与伊莎贝拉女王感到震惊不已。身能成为西班牙财富的来源，对统治者而言，这自然是个难以抗拒的诱惑。然而，要获得美洲财富，就必须镇压从未冒犯过西班牙的美洲原住民。
费迪南德与伊莎贝拉的顾虑是有道理的，印第安人不同于伊斯兰帝国，后者数百年来一直与他们以及他们的祖先争战不休。对费迪南德与伊莎贝拉来说，穆斯林的军队是可以正当地加以奴役的——穆斯林曾经征服西班牙大部分地区，剥削西班牙人民，而且由于信仰伊斯兰教的缘故，他们反对基督教。〈基于类似的理由，伊斯兰帝国也任意将西班牙战俘充为奴隶。)相对地，绝大多数的印第安人并未侵犯过西班牙人。由于美洲原住民从未听过基督教，因此也就没有悖离基督教的问题。一四九三年，教宗亚历山大六世解决了良心的两难问题。他让君主「拥有对西班牙岛塔伊诺人充分、自由与完全的权力、权威与管辖权」，只要他们「能派遣审慎与畏神之人，有学问、具技巧，且足证得以前去教导天主的信仰」。
只要目的是为了让被征服者得到救赎，那么征服是可接受的。
然而，前往新世界的西班牙人对于传布福音兴趣缺缺。虽然他们是虔诚的信徒，但他们关切的不是印第安人的獭魂，而是他们的劳动力。哥伦布就是个例证。尽管他非常虔诚，他在一四九五年的行为却令伊莎贝拉女王感到惊骇，他把五百五十名俘获的塔伊诺人送到西班牙，并且把他们当成贾列船奴隶卖了 (贾列船仍是地中海常见的船只)。哥伦布认为，将战俘充为奴隶是合理的，他对待攻撃拉伊莎贝拉岛上的印第安人，就跟西班牙人长久以来对待军事敌人的方式一样。此外，他表示，以这种方式对待印第安人可以吓阻进一步的暴乱。伊莎贝拉女王不同意他的看法。心中不满的她，眼睁睁地看着上了枷锁的塔伊诺人被送往塞维尔的奴隶市场。一四九九年，她在盛怒之下，下令拥有印第安人的西班牙人必须将他们送回美洲，不从者一律处以死刑。
让女王大为光火的，主要是因为殖民者的放肆胡为，他们不遵从命令，任意以人为奴。但她肯定也知道自己未能解决最根本的问题。一方面，教宗已经认定西班牙的征服是合理行为，传教士因此可以向印第安人传教，如果印第安人大量沦为奴隶，那么这项使命就不可能实现。另一方面，殖民地可以增添西班牙的荣耀，但这项任务的实现必须仰赖劳动力。西班牙不像英格兰有完善的契约奴隶讯只，下象案各因盲大置无业灵歆可以引诱也斗前住瓶外。费迪南德与伊莎贝拉相信，为了从殖民地获取利益，西班牙必须仰赖印第安人的劳动力。
一五0三年，国王与女王针对难题提出解决之道：信托制。个别西班牙人成为原住民团体的受托人，承诺确保原住民的安全、自由与宗教指导。反之，印第安人必须提供自己的劳动力来换取西班牙人的「保护」。籍言可以用来响应亚当斯密对奴隶制度的反对意见。国王与女王希望藉由限制对印第安人的需求，来消除印第安人的叛心，这对雇用印第安人的西班牙人来说是件好事。